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質(zhì)粒提取

質(zhì)粒DNA提取方法有3種:堿裂解法、煮沸法和去污劑(如Triton和SDS)裂解法。前兩種方法比較劇烈,適用于較小的質(zhì)粒

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

質(zhì)粒DNA提取方法有3種:堿裂解法、煮沸法和去污劑(如Triton和SDS)裂解法。前兩種方法比較劇烈,適用于較小的質(zhì)粒(


【實(shí)驗(yàn)流程】

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常見問題

常見問題:未提出質(zhì)?;蛸|(zhì)粒得率較低。

可能原因及解決方法:

(1)大腸桿菌老化:涂布平板培養(yǎng)后,重新挑選新菌落進(jìn)行液體培養(yǎng);

(2)質(zhì)??截悢?shù)低:由于使用低拷貝數(shù)載體引起的質(zhì)粒DNA提取量低,可更換具有相同功能的高拷貝數(shù)載體;

(3)堿裂解不充分:使用過多菌體培養(yǎng)液,會導(dǎo)致菌體裂解不充分,可減少菌體用量或增加溶液的用量。對低拷貝數(shù)質(zhì)粒,提取時(shí)可加大菌體用量并加倍使用溶液,可以有助于增加質(zhì)粒提取量和提高質(zhì)粒質(zhì)量;

(4)洗脫液不合適:DNA只在低鹽溶液中才能被洗脫,如洗脫緩沖液EB(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH8.5)或水。洗脫效率還取決于pH值,最大洗脫效率在pH7.0-8.5間。當(dāng)用水洗脫時(shí)確保其pH值在此范圍內(nèi),如果pH過低可能導(dǎo)致洗脫量低。洗脫時(shí)將滅菌蒸餾水或洗脫緩沖液加熱至60℃后使用,有利于提高洗脫效率。

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

樣品類型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
動(dòng)物組織單個(gè)樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識
種子樣本去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個(gè)樣品>0.2g。-80℃干冰
貼壁/懸浮細(xì)胞

1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107     cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細(xì)胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃       

2. 若細(xì)胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量

-80℃干冰
全血/血清樣品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細(xì)胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蠟包埋樣品由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。-20℃冰袋
抗體

1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實(shí)驗(yàn)要求的抗體;

2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并提供抗體說明書。

3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),每個(gè)基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。-20℃冰袋或常溫




細(xì)胞交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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