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外泌體鑒定

外泌體是一種由活細(xì)胞分泌,直徑在40-150nm,具有雙層脂質(zhì)膜結(jié)構(gòu)的小囊泡,它在機(jī)體內(nèi)廣泛存在,如外周血、腹水、尿液、唾液、腦脊液等各種體液中。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【鑒定方法】

基于SEC+超濾的外泌體分離方法,可方便快捷進(jìn)行高純度及高回收率的外泌體分離。以熒光外泌體作為標(biāo)準(zhǔn)品,Exosupur可回收94.87%的熒光外泌體;能夠去除99.44%的血漿游離雜蛋白,如主要的miRNA結(jié)合蛋白Ago、血漿雜蛋白HAS在Exosupur中更少;跟超離及市面常見(jiàn)試劑盒相比,該方法提取的外泌體的particle數(shù)與蛋白含量比值更高,表明分離得外泌體純度更高,雜蛋白含量更低。

MISEV2018(細(xì)胞外囊泡雜志)對(duì)外泌體的表征規(guī)定了最小試驗(yàn)要求:

① 總體表征:

至少3個(gè)陽(yáng)性(至少包括1個(gè)跨膜蛋白和1個(gè)細(xì)胞溶質(zhì)蛋白)、1個(gè)陰性蛋白質(zhì)標(biāo)志物。

② 個(gè)體表征:

電鏡或原子力顯微鏡、單顆粒追蹤兩種方法互為補(bǔ)充。

1、電鏡檢測(cè)

透射電子顯微鏡觀察法(TEM)是從形態(tài)和大小上對(duì)外泌體進(jìn)行鑒定。通過(guò)負(fù)染的方法,在高倍放大下直接觀察單個(gè)外泌體的形態(tài)結(jié)構(gòu)和大小。

檢測(cè)儀器:透射電子顯微鏡(HITACHI,H-7650)

樣本要求:BCA濃度300-400ng/μl,體積10μl;避免反復(fù)凍融,4℃保存,冰袋運(yùn)輸。

結(jié)果呈現(xiàn):



2、粒徑檢測(cè)

粒徑分析是從整體上對(duì)外泌體大小的分布情況進(jìn)行檢測(cè),具有準(zhǔn)確、快速、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn),是對(duì)現(xiàn)有外泌體鑒定方法的良好補(bǔ)充。

檢測(cè)儀器:Particle Metrix(ZetaView)

樣本要求: 避免反復(fù)凍融,4℃保存,冰袋運(yùn)輸。

結(jié)果呈現(xiàn):

樣本名稱(chēng)

平均粒徑(nm)

粒徑主峰(nm)

主峰所占百分比(%)

濃度

(Particles / mL)

血漿

105.7

85.5

99.2

1.0E+8

3、Western Blot檢測(cè)

Western blot是通過(guò)抗原抗體特異性結(jié)合的原理,對(duì)外泌體標(biāo)志蛋白進(jìn)行檢測(cè),從蛋白質(zhì)層面對(duì)外泌體進(jìn)行鑒定。常用的外泌體標(biāo)志蛋白包括CD63、TSG101及Alix等。

檢測(cè)方法:ECL化學(xué)發(fā)光,傳統(tǒng)膠片曝光或者專(zhuān)用曝光儀器。

樣本要求:血漿樣本BCA量60ug,>0.5μg/μl;細(xì)胞上清BCA量40μg,>0.5μg/μl;冰袋運(yùn)輸。

結(jié)果呈現(xiàn):


案例展示

外泌體鑒定_副本.jpg

技術(shù)總結(jié)

【常見(jiàn)問(wèn)題】

1、血漿電鏡圖片為什么背景那么雜?

答:血漿中雜蛋白如糖蛋白、鐵蛋白,低密度脂蛋白等粒徑大小與外泌體非常接近,且

含量偏高,現(xiàn)有的分離方法無(wú)法完全剔除,所以會(huì)出現(xiàn)有一些雜蛋白背景。


2、CD63 條帶為什么呈彌散狀?這樣發(fā)文章能用嗎?

答:由于 CD63 的糖基化水平不同,導(dǎo)致其條帶呈彌散狀,這是蛋白本身的特點(diǎn),所以不會(huì)

影響文章的發(fā)表。

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)

【送檢標(biāo)準(zhǔn)】

(一)、血漿樣本采集

1、請(qǐng)用EDTA抗凝管采集患者血液(a),若不能第一時(shí)間處理,請(qǐng)于4℃臨時(shí)保存(不得超過(guò)4 h);

2、將采集到的血液在4℃下1500 g,離心20 min,去除血液中的細(xì)胞;

3、取上清,4℃下3000 g,離心15 min,收集上清(血漿),-80℃保存。

4、送樣量: 排阻+超濾      4mL(夠2次分離)

             超離      4mL

注意事項(xiàng):①請(qǐng)勿使用含肝素抗凝劑的采樣管收集盛放;②請(qǐng)排除乙肝病毒,HIV等病毒感染樣本。


(二)、血清樣本采集

1、請(qǐng)用EDTA抗凝管采集患者血液(a),若不能第一時(shí)間處理,請(qǐng)于4℃臨時(shí)保存(不得超過(guò)4 h);

2、將采集到的血液在4℃下1500 g,離心20 min,去除血液中的細(xì)胞;

3、取上清,4℃下13000 g,離心2 min,收集上清(血清),-80℃保存。

4、送樣量:       超離      4 mL

                排阻+超濾      1mL

注意事項(xiàng):請(qǐng)排除乙肝病毒,HIV等病毒感染樣本。


(三)、尿液樣本采集

1、采集前/中后段晨尿約60 mL,若不能第一時(shí)間處理,請(qǐng)于4℃臨時(shí)保存(不得超過(guò)8 h);

2、將采集到的尿液在4℃下(室溫亦可)離心2000 g,20 min,去除尿液中的細(xì)胞;-80℃保存;

3、送樣量:60 mL。

注意事項(xiàng):請(qǐng)務(wù)必囑咐患者,采集晨尿,或6 h以上未排尿亦可;中段尿請(qǐng)務(wù)必去掉最初排出的50-80 mL尿液;③女性受試者,請(qǐng)于采尿前對(duì)外陰進(jìn)行清洗。


(四)、胸水樣本采集

1、臨床收集胸水后若不能第一時(shí)間處理,請(qǐng)于4℃臨時(shí)保存(不得超過(guò)8 h);

2、將收集到的胸水1000 g離心10 min,收集上清液;

3、將得到的胸水上清3000 g離心10 min,收集上清,-80℃保存。

4、送樣量:30 mL


(五)、腹水樣本采集

1、臨床收集腹水后若不能第一時(shí)間處理,請(qǐng)于4℃臨時(shí)保存(不得超過(guò)8 h);

2、將采集到的腹水在4℃下(室溫亦可)離心2000 g,20 min,去除腹水中的殘?jiān)?80℃保存;

3、送樣量:30 mL。


(六)、腦脊液樣本采集

1、采集方式為腰椎穿刺,樣本一經(jīng)分離,請(qǐng)務(wù)必立即置于冰上或4℃短暫保存(不得超過(guò)4 h),采樣時(shí)注意避免血液污染;

2、樣本室溫下2000 g離心20 min去除細(xì)胞及部分碎片,取上清,-80℃保存;

3、送樣量:5 mL。

注意事項(xiàng):請(qǐng)勿使用含肝素抗凝劑的采樣管收集盛放。


(七)、膽汁樣本采集

1、用無(wú)菌容器收集膽汁;

2、將收集到的膽汁在4℃下,3000 g離心10 min去除細(xì)胞沉渣和碎片;

3、收集膽汁上清液,4℃或者-20℃長(zhǎng)期保存;

4、送樣量:5 mL。


(八)、細(xì)胞樣本采集

對(duì)于耐受無(wú)血清培養(yǎng)的細(xì)胞的處理流程:

1、細(xì)胞培養(yǎng):對(duì)于貼壁細(xì)胞匯合密度在70%以上,用PBS洗滌細(xì)胞2-3遍去除殘留牛血清,添加無(wú)血清培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí);

2、上清收集:細(xì)胞上清先用200-300g離心10min,再用3000g離心10min,最后0.22um過(guò)膜或者10000g離心30min。將處理后的細(xì)胞上清經(jīng)100kd超濾管超濾濃縮(詳見(jiàn)參考文獻(xiàn)2.1);

3、儲(chǔ)存運(yùn)輸:將處理好的細(xì)胞上清收集在無(wú)菌培養(yǎng)瓶,-80保存或者干冰運(yùn)輸,體積需求細(xì)胞上清原液大于200ml(對(duì)應(yīng)于10cm的大皿,至少需要20大皿)

4、對(duì)于一些狀態(tài)良好的細(xì)胞上清,少至70ml,也可以得到較好的外泌體分離結(jié)果。


對(duì)于不耐受無(wú)血清培養(yǎng)的細(xì)胞的處理流程:

1、細(xì)胞培養(yǎng):對(duì)于貼壁細(xì)胞匯合密度在70%以上,用PBS洗滌細(xì)胞2-3遍去除殘留牛血清,添加含5%無(wú)外泌體血清的培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24小時(shí);

2、上清收集:細(xì)胞上清先用200-300g離心10min,再用3000g離心10min,最后0.22um過(guò)膜或者10000g離心30min。將處理后的細(xì)胞上清經(jīng)100kd超濾管超濾濃縮(詳見(jiàn)參考文獻(xiàn)2.1);

3、儲(chǔ)存運(yùn)輸:將處理好的細(xì)胞上清收集在無(wú)菌培養(yǎng)瓶,-80保存或者干冰運(yùn)輸,體積需求細(xì)胞上清原液大于200ml(對(duì)應(yīng)于10cm的大皿,至少需要20大皿);

4、對(duì)于一些狀態(tài)良好的細(xì)胞上清,少至70ml,也可以得到較好的外泌體分離結(jié)果。

5、送樣量:細(xì)胞上清原液建議大于200 mL。

注:細(xì)胞上清樣本按照送樣體積收費(fèi),超濾濃縮步驟可選擇自己完成也可直接送公司完成。

參考文獻(xiàn):Rong Xu, David W. Greening , Alin Rai, Hong Ji, Richard J. Simpson. Highly-purified exosomes and shed microvesicles isolated from the human colon cancer cell line LIM1863 by sequential centrifugal ultrafiltration are biochemically and functionally distinct. Methods. 2015 .1;87:11-25


【交付標(biāo)準(zhǔn)】


交付標(biāo)準(zhǔn)副本.jpg

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