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RNA熒光原位雜交

將核酸探針的某一種核苷酸標(biāo)記上報(bào)告分子如生物素或直接標(biāo)記熒光素,可利用該報(bào)告分子與熒光素標(biāo)記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng)或直接經(jīng)熒光檢測(cè)體系在鏡下對(duì)待測(cè)核酸(mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA)進(jìn)行定性、半定量或相對(duì)定位分析的一種實(shí)驗(yàn)方法。

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實(shí)驗(yàn)介紹

【技術(shù)原理】

        RNA-FISH原理:如果待檢測(cè)的細(xì)胞或組織切片上的靶核酸與所用的核酸探針是同源互補(bǔ)的,二者經(jīng)‘’變性-退火-復(fù)性‘’,即可形成靶核酸與核酸探針的雜交體。將核酸探針的某一種核苷酸標(biāo)記上報(bào)告分子如生物素或直接標(biāo)記熒光素,可利用該報(bào)告分子與熒光素標(biāo)記的特異親和素之間的免疫化學(xué)反應(yīng)或直接經(jīng)熒光檢測(cè)體系在鏡下對(duì)待測(cè)核酸(mRNA、lncRNA、circRNA、miRNA)進(jìn)行定性、半定量或相對(duì)定位分析的一種實(shí)驗(yàn)方法。


【實(shí)驗(yàn)流程】


原位雜交.png

案例展示

1591342997501883.png熒光原位雜交.jpg


細(xì)胞的circRNA熒光原位雜交

注意事項(xiàng)

1、烤好的組織切片需經(jīng)過(guò)脫蠟處理,二甲苯脫蠟不足會(huì)導(dǎo)致探針雜交強(qiáng)度和雜交效率降低、熒光背景高等,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果??筛鶕?jù)實(shí)際情況延長(zhǎng)脫蠟時(shí)間。

2、酶消化注意事項(xiàng):

酶的濃度過(guò)高、消化時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或孵育溫度過(guò)高,會(huì)對(duì)細(xì)胞的結(jié)構(gòu)有一定的破壞,細(xì)胞核消失或細(xì)胞核辨認(rèn)不清,也會(huì)造成一定程度的組織脫片;

酶消化不足會(huì)造成蛋白消化不透徹,降低組織的通透性以及雜交信號(hào)的強(qiáng)度和雜交率;

消化酶均為現(xiàn)用現(xiàn)配。

3、由于熒光原位雜交探針雜交的區(qū)段長(zhǎng),在組織或細(xì)胞塊切片中,可能出現(xiàn)人為的信號(hào)異常,如缺失、分離等。

送檢與交付標(biāo)準(zhǔn)


樣品類(lèi)型樣品需求保存條件運(yùn)輸條件備注
新鮮組織新鮮取材組織,用 PBS 清洗干凈血液等,立即-80℃保存-80℃干冰所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識(shí)
一般固定組織一般組織體積不超過(guò)2cmX2cmX0.5cm,固定時(shí)盡量保持組織的原有形態(tài)并清理干凈血液及多余部分,如腸道內(nèi)容物;固定液體積為組織大小的10倍以上,容器足夠容納組織不使其擠壓變形。標(biāo)注好固定液類(lèi)型和固定時(shí)長(zhǎng)常溫常溫
特殊固定組織睪丸、眼球、脊髓、肌肉等組織:推薦使用對(duì)應(yīng)的特殊固定液進(jìn)行固定,以保證固定效果。如Bouin液,適用于睪丸組織、皮膚組織及眼球的固定

組織蠟塊組織由標(biāo)準(zhǔn)的石蠟包埋盒包埋(尺寸為30*24*7mm),石蠟與組織要均勻接合,不能有裂痕;蠟塊厚度根據(jù)所需切片的數(shù)量而定,有效厚度至少要超過(guò) 0.1cm。盡量提供半年內(nèi)的組織蠟塊,超過(guò)半年的蠟塊抗原可能丟失,做免疫組化可能出現(xiàn)檢測(cè)不到蛋白。常溫常溫
組織切片需用防脫載玻片進(jìn)行撈片,并注明切片厚度、已烤片溫度與時(shí)間,組織應(yīng)在靠近切片下端 1/3 處。4℃冰袋
細(xì)胞爬片使用 12 孔板或 24 孔板專(zhuān)用細(xì)胞爬片,細(xì)胞爬片經(jīng)固定后用 PBS 洗滌 2~3 次,保存在 PBS 中,用封口膜密封孔板。每個(gè)爬片在孔板蓋上應(yīng)有唯一的標(biāo)記,并有電子版的分組信息,以防標(biāo)記在運(yùn)輸途中模糊。常溫常溫
植物樣本新鮮組織FAA固定,木質(zhì)化程度不高;對(duì)于較薄的葉片,如果要求平行葉片切片,難以保證切完整;根莖要求直徑>1mm常溫常溫
抗體保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識(shí)別此抗體的標(biāo)記,并附帶說(shuō)明書(shū),抗體的量應(yīng)大于實(shí)驗(yàn)所需的量。組織切片、組織芯片按稀釋后 100μl 一張切片計(jì)算抗體用量, 24 孔板細(xì)胞爬片圓形蓋玻片按稀釋后 200μl 一張計(jì)算抗體用量,12 孔板細(xì)胞爬片圓形蓋玻片按稀釋后 400μl 一張計(jì)算抗體用量。-20℃冰袋或干冰




病理交付標(biāo)準(zhǔn).jpg

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