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【精品導(dǎo)讀】單細胞測序揭示男性不育問題

2023-07-24 13:55:04

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺

上個月為大家分享了一篇《Nature Communications》中的單細胞文章,今天小編再給大家提供一個單細胞研究案例,對照兩年內(nèi)同水平文章內(nèi)容深度變化,可以發(fā)現(xiàn)目前僅憑單細胞測序要想出高分文章已經(jīng)不夠了,需要增加研究深度及實用性,但從細胞層面來揭示和攻克疑難科學(xué)問題仍是未來研究的熱門趨勢,也是治療疑難雜癥的理論基礎(chǔ)。

本研究案例為多院校合作研究團隊從細胞水平揭示了:睪丸支持細胞發(fā)育路徑及其在非梗阻性無精子癥(NOA)中的重要作用。為治療男性不育問題帶來了新的思路。

論文鏈接:110.1038/s41467-020-19414-4

研究背景


非梗阻性無精子癥(NOA)是男性不育的最嚴重的形式,發(fā)生在10-15%的不育男性中。然而,僅有少部分是由先天因素造成的,大部分是由未知原因引起,也被稱為特發(fā)性NOA(iNOA),占70%以上,盡管通過手術(shù)后可以在iNOA患者中發(fā)現(xiàn)精子,但成功率極低。



精子發(fā)生取決于體細胞微環(huán)境的完全成熟,因此對NOA患者進行有效的病因分析和治療,就需要充分了解體細胞微環(huán)境中細胞的變化情況。作者對10名不同年齡段的健康組和7名NOA患者組進行了8萬個睪丸細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,揭示了不同NOA支持細胞的病理變化和成熟障礙,還獲得了Wnt信號通路調(diào)節(jié)正常和NOA支持細胞成熟的證據(jù),為生精微環(huán)境的成熟和發(fā)病機制提供了深入的見解,也為臨床NOA的診斷方法和治療靶點提供了新的思路。


研究結(jié)果

一、睪丸支持細胞影響著NOA的發(fā)生


研究者從10名生精正常樣本(嬰兒到成年)和7名NOA患者共獲得88723個睪丸細胞,每個細胞平均檢測到2719個基因(圖1a-c)。對正常不同年齡段與不同NOA患者睪丸細胞UAMP分析(圖d-f)及細胞差異度分析(圖1g),正常成人和三種NOA患者的支持細胞最為顯著,表明NOA患者的體細胞微環(huán)境的變化主要發(fā)生在支持細胞中。因此睪丸支持細胞可能影響著NOA的發(fā)生。


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圖1嬰兒期至成年期和NOA患者的人類睪丸細胞的整體表達譜分析

二、睪丸支持細胞經(jīng)歷了三個不同的連續(xù)發(fā)育階段



研究者對10個生精正常供體的支持細胞進行重聚類和擬時序分析,睪丸支持細胞的增殖、能量代謝等表明支持細胞經(jīng)歷了3個不同的連續(xù)發(fā)育階段(圖2a-b)。隨著年齡的增長,Stage_a占比逐漸降低,Stage_b占比逐漸增加,青春期時期Stage_c出現(xiàn),在青春期后期發(fā)育至穩(wěn)定狀態(tài)(圖2c)。通過差異基因分析(圖2d)、功能富集分析(圖2e)及免疫組化在蛋白層面的驗證(圖2f),還發(fā)現(xiàn)睪丸支持細胞的主要功能與生殖細胞及其代謝物清除有著密切聯(lián)系。


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圖2 支持細胞3個發(fā)育階段的鑒定

三、睪丸支持細胞成熟的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的解釋



通過IPA結(jié)果表明從Stage_a到Stage_b過程中細胞增殖相關(guān)信號被抑制,上皮細胞粘附分子連接的重塑信號被激活;從Stage_b到Stage_c過程中Wnt/β-連環(huán)蛋白信號被抑制,而生殖細胞-支持細胞連接信號等被激活(圖3a-b),表明支持細胞的增殖發(fā)生在Stage_a,結(jié)構(gòu)重塑發(fā)生在Stage_b,揭示了支持細胞成熟的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。


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圖3 支持細胞3個發(fā)育階段的推斷信號通路

四、iNOA患者成熟缺陷的相關(guān)信號的揭示



通過UMAP分析顯示支持細胞可分為三個亞群,即cluster1-2(iNOA支持細胞組成)和cluster 3(健康成人支持細胞),且發(fā)現(xiàn)cluster1與的Stage_a相似,cluster2與的Stage_b相似(圖4a-b)。通過IPA分析Wnt通路在cluster1-2中被激活,而正常支持細胞中Wnt細胞通路被抑制(圖4c-d)。因此,推測Wnt通路的異常激活導(dǎo)致iNOA支持細胞的成熟缺陷。


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圖4 iNOA支持細胞的異質(zhì)性和成熟停滯

五、抑制Wnt信號通路可緩解支持細胞的成熟障礙



通過對來自iNOA病人和正常支持細胞進行了體外培養(yǎng),并添加不同的Wnt信號通路抑制劑,結(jié)果發(fā)現(xiàn)抑制劑ICG顯著降低了iNOA和正常支持細胞的增殖(圖5a);通過探究不同處理的支持細胞對生殖細胞的影響發(fā)現(xiàn)ICG可促進生殖細胞的增殖(圖5b-c)。因此,抑制Wnt途徑可有效緩解iNOA支持細胞的成熟障礙并促進生殖細胞的正常功能。


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圖5 抑制Wnt通路可體外誘導(dǎo)支持細胞的成熟

全文提煉


該研究通過分析不同年齡正常人類和NOA患者的單細胞轉(zhuǎn)錄組,不僅揭示了正常睪丸中主要細胞類型及其成熟過程,發(fā)現(xiàn)了支持細胞經(jīng)歷三個獨立且連續(xù)的發(fā)育階段(Stage_a、Stage_b和Stage_c),還通過比較主要類型NOA患者睪丸細胞的成熟障礙揭示了不同類型NOA的發(fā)病機制,還發(fā)現(xiàn)了抑制Wnt途徑可有效緩解iNOA支持細胞的成熟障礙并促進生殖細胞的正常功能。為進一步研究睪丸支持細胞的發(fā)育提供了理論基礎(chǔ),為開發(fā)NOA的診斷和治療方法鋪平了道路。



結(jié)語


單細胞測序指在單個細胞水平上進行基因組、轉(zhuǎn)錄組或表觀組測序的技術(shù),近幾年單細胞測序技術(shù)取得飛速發(fā)展及矚目成果,越來越多的高水平文章橫空出世,在腫瘤、微生物、免疫學(xué)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域正在慢慢得到應(yīng)用。
普拉特澤生物已搭建全新單細胞多組學(xué)測序分析平臺,擁有過硬的實驗技術(shù)團隊和豐富的項目經(jīng)驗可以為廣大科研工作者和臨床工作者提供更為優(yōu)質(zhì)的單細胞多組學(xué)服務(wù),包括:單細胞轉(zhuǎn)錄組,單細胞轉(zhuǎn)錄組+V(D)免疫組聯(lián)合分析,單細胞ATAC以及單細胞ATAC+mRNA聯(lián)合分析。此外我們還提供利用Feature Barcoding的單細胞表面蛋白檢測,及單細胞表面抗原特異性檢測等服務(wù)。
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