
Image J處理WB蛋白條帶并用Graphpad美圖全
2026-02-04 14:41:00
來(lái)源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
對(duì)于生信的小伙伴來(lái)說(shuō),Western Blot是最常用的蛋白定量表征手段之一。WB不僅用于判斷蛋白是否表達(dá),更重要的是用于半定量比較不同樣品中目標(biāo)蛋白的相對(duì)含量變化。通過(guò)對(duì)條帶灰度值的測(cè)量,并結(jié)合內(nèi)參蛋白進(jìn)行歸一化處理,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白表達(dá)水平的可靠比較。
本期普拉特澤生物來(lái)分享如何使用Image J對(duì)WB進(jìn)行蛋白定量并用Graphpad美圖全過(guò)程。
1.打開(kāi)Image J軟件,跳出彈窗,如下圖所示;
2.點(diǎn)擊File—Open—選擇打開(kāi)目標(biāo)WB蛋白條帶;
3.依次點(diǎn)擊Image—Type—8bit;
4.去除背景影響,點(diǎn)擊Process—Subtract Background,在跳轉(zhuǎn)出的對(duì)話框,在Rolling ball radius 選擇50pixels;
5.設(shè)置參數(shù),點(diǎn)擊Analyze—Set Measurements—選擇參數(shù)Area、Min& max gray value、Integrated density和Mean gray value;
6.接著點(diǎn)擊矩形,勾選出條帶部分;
7.點(diǎn)擊Analyze—Gels—Select First Lane;接著再點(diǎn)擊Analyze—Gels—Plot Lanes;
8.在跳出的對(duì)話框,點(diǎn)擊直線,按住shift鍵,依次對(duì)各個(gè)峰進(jìn)行繪制封閉;
9.點(diǎn)擊魔法棒工具,依次點(diǎn)擊各個(gè)峰,會(huì)跳出的各個(gè)峰的面積,即為WB各個(gè)蛋白條帶的面積;按照上述步驟,重復(fù)平行操作3次。
10.復(fù)制值到Excel中,對(duì)所有值進(jìn)行內(nèi)參歸一化。
11.打開(kāi)Graphpad軟件,選擇Column,點(diǎn)擊create;
12.將數(shù)據(jù)導(dǎo)入到軟件中,點(diǎn)擊Analyze—選擇One-way ANOVA,點(diǎn)擊ok;
13.點(diǎn)擊繪圖,選擇Individual values,選擇帶數(shù)據(jù)點(diǎn)的柱形圖;
14.接著對(duì)圖形進(jìn)行美化,其中包括顏色、圖形邊框、字體、坐標(biāo)軸等,其最終效果圖如下圖所示:
ImageJ的WB定量,本質(zhì)是:在相同ROI下提取條帶積分灰度→扣背景→用內(nèi)參歸一化→轉(zhuǎn)換為可統(tǒng)計(jì)的表達(dá)量變化→使用繪圖軟件繪圖。大家學(xué)會(huì)了嗎?