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一張圖搞懂qPCR實(shí)驗(yàn)中CT值的定義

2026-02-10 17:14:15

來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)


先看懂qPCR擴(kuò)增曲線的一生

這是 qPCR 擴(kuò)增的全過程,分 3 個(gè)階段:

1. 起始期:剛開始循環(huán),DNA 剛復(fù)制,熒光信號弱,和背景噪音差不多,儀器檢測不到明顯變化;

2. 指數(shù)期DNA 片段以 2?的速度快速復(fù)制,熒光信號呈指數(shù)增長,這個(gè)階段的擴(kuò)增效率最穩(wěn)定,是最能反映模板初始量的階段;

3. 平臺(tái)期:原料耗盡,擴(kuò)增減速,熒光信號不再增加,曲線趨于平緩。

2

CT 值

CT 值:“熒光達(dá)標(biāo)” 時(shí)的循環(huán)數(shù)。上圖中那條灰色的閾值線(Threshold),是儀器設(shè)定的可檢測熒光信號閾值。CT 值(Cycle Threshold),就是熒光信號剛好跨過這條門檻時(shí),PCR 已經(jīng)跑了多少個(gè)循環(huán)。

綠色曲線:在更早的循環(huán)就達(dá)標(biāo) → CT 值更?。ㄕf明它的初始量多,只需要跑幾圈就到閾值線)

 紅色曲線:需要更多循環(huán)才能達(dá)標(biāo) → CT 值更大(說明它初始含量低,需要多跑幾圈才能到閾值線)。

3

CT 越小,初始基因越多

qPCR 的定量原理很直接:如果樣品里的目標(biāo)基因初始含量越高,DNA 復(fù)制到 “能被檢測到” 的速度就越快,對應(yīng)的 CT 值就越??;反之,初始含量越低,CT 值就越大。

比如

 過表達(dá)(OE)組的 CT 值 < 對照組 → 說明目標(biāo)基因表達(dá)量更高

敲低(KD)組的 CT 值 > 對照組 → 說明目標(biāo)基因表達(dá)量更低。

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